代謝システム研究チーム
Metabolic Systems Research Team
- 研究分野：
- 総合生物
- 研究関連分野：
- 生物学/農学
- キーワード：
- 代謝/メタボロミクス/数理モデリング/植物/二次代謝産物
- 参画プロジェクト：
- 代謝ゲノムエンジニアリング/先端技術プラットフォーム
M
TP
代謝のメカニズムと生理機能を理解して、植物による有用物質生産の向上を目指します
チームリーダー
平井 優美 Masami Yokota Hirai 博士（農学）
- 1994
- 東京大学大学院農学系研究科 博士学位取得
- 1994
- 日本学術振興会 特別研究員（東京大学）
- 1997
- 日本学術振興会 未来開拓学術研究推進事業 ポスドク研究員（千葉大学）
- 2001
- 科学技術振興機構 CRESTポスドク研究員（千葉大学）
- 2005
- 理化学研究所 植物科学研究センター 代謝システム解析ユニット ユニットリーダー
- 2005
- 名古屋大学大学院生命農学研究科 客員助教授
- 2006
- 東京大学大学院総合文化研究科広域科学専攻生命環境科学系 客員准教授
- 2007
- 名古屋大学大学院生命農学研究科 客員教授（現職）
- 2008
- 理化学研究所 植物科学研究センター 代謝システム解析チーム チームリーダー
- 2010
- 中国 東北林業大学アルカリ土壌生物資源環境研究センター 客員教授
- 2013
- 理化学研究所 環境資源科学研究センター 代謝システム研究チーム チームリーダー（現職）
- 2020
- 同 環境資源科学研究センター 質量分析・顕微鏡解析ユニット ユニットリーダー（現職）
お問合せ
理化学研究所 環境資源科学研究センター
代謝システム研究チーム
masami.hirai
関連リンク
研究室が運営しているウェブサイト
代謝システム研究チーム
理化学研究所ウェブサイト内の紹介ページ
代謝システム研究チーム | 理化学研究所
研究概要
研究テーマ
- アミノ酸生合成制御機構の解明
- 植物特化代謝産物の生合成と分解に関わる遺伝子同定
- 植物の発生を制御する代謝経路の同定
- 機械学習や数理モデリングによるメタボロームのデータマイニング
- 代謝産物時系列データに基づく代謝反応ネットワーク推定の概念図
- 代謝産物濃度の時系列データをつなぐ近似曲線の補正（スムージング）、時系列データに基づくグレンジャーの因果関係の検定、バイオケミカルシステム理論による代謝反応ネットワークのモデリング、非線形最小二乗法によるパラメータ決定、という4つの理論を組み合わせて代謝反応ネットワークを推定する新たなアルゴリズムを開発した。(Sriyudthsak et al. PLOS ONE 2013)
- グルコシノレート生合成を制御する鍵転写因子の同定
- トランスクリプトームデータを用いた遺伝子共発現解析により、健康機能成分グルコシノレート類の生合成に関わる遺伝子群を予測し、ワイドターゲットメタボロミクス等による機能証明を行った。（Hirai et al. PNAS 2007）
